第一百八十三章 老裘,你的病有救啦！(5.4K)（2 / 2）

也就是16srrna。

这部分长度大约1500nt不同物种略有差异算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

五分钟后。

裘生抬起头对徐云道：

“老徐准备好了引物你觉得用啥？”

徐云想了想很快道：

“1492r吧。”

“好嘞！”

半个小时后。

裘生抬起头打了个响指：

“搞定扩出来了blast的密匙你有吧？”

徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮随后走到操作台边噼里啪啦的输了一大串密匙。

做过新种检测的同学应该都知道。

16s相似度检测的界限其实有些模糊因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

比如有的是97%有的是99%。

只是在通常情况下。

相似度超过97%的就可以认为是一个物种。

相似度低于97%的就可以认为是不同物种进行下一阶段检测。

不过就是这样一种不太精细的检测手段却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：

大部分样本在经过检测之后都会发现相似度在9999%以上与其他某某微生物是同一物种。

总而言之。

这项技术在定属方面还是靠谱的。

又过了一会儿。

裘生一脸惊喜的抬起头声音骤然拔高了几分：

“老徐相似度469%469%！！”

“毫无疑问这是一类新物！”

徐云认真的看了他一眼确认道：

“只有一种新物吗？”

“没错只有一种！”

徐云若有所思的点点头又道：

“那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

众所周知。

新物鉴定一般都有九个流程：

1、16s相似度。

2、形态学观察。

比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等还包括最适生长条件的确定。

3、磷脂脂肪酸鉴定这个具有属特异性。

4、呼吸醌也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种这个有种特异性。

5、分子杂交也就是测定基因组序列草图就行然后跟近源物种去比较。

相似度超过70%是一个种低于70%是不同物种。

6、碳源利用情况看一下能利用哪些碳源一共有95种碳源的测试。

7、api试剂盒鉴定生理生化鉴定的一方面。

8、gc含量。

9、革兰氏染色。

大概经过这些方面的检查就可以确定是不是新种了。（注：不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看？这种详细流程应该没有其他书写过找人问其实很麻烦的要是还被嫌水下次我就不写了）

其中第五个流程也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部测出来的469%实在是差距太明显了。

考虑到时间问题徐云将几个步骤逐一分工由几位工具人咳咳课题组成员同步进行。

五个小时后。

一道最终报告出炉了。

“节丛孢属的一类全新微生物1000倍油镜下可观察到形态体外具备大量假丝。”

“这种假丝可以分离与目标结合完成某种化合反应这是秃头攻击？”

“一片青苔中可以高密度富集8000单位的极少量新物特性上与嗜酸乳杆菌有一定类似嗯？”

随后看着其中的一栏报告徐云有些疑惑的抬起头对裘生问道：

“老裘新物对食物残渣的净化效果最为明显？”

裘生点了点头指着不远处的一个培养皿道：

“经过我们的初步检测这种新型微生物可以有效遏制残渣中氨气、有机酸和硫化物的生成。”

“并且对奈瑟氏菌和厌氧链球菌之类的细菌有着极强的杀伤力。”

徐云微微一愣：

“奈瑟氏菌和厌氧链球菌？”

不过很快他便反应了过来：

这两种西军都是人体唾液和牙龈的标准分泌物之一：

每一毫升的普通唾液里可以寻找出奈瑟氏菌8000万个在每一克牙龈分泌物中更是可以寻找出10亿个厌氧链球菌。

在食堂里吐出骨头啦、吐出西红柿皮啦、吐出半截蛆虫时沾染上这些细菌最后流入下水管道是很正常的事情。

接着徐云指着报告对裘生说道：

“老裘新种只对食物残渣和唾液细菌有效吗？”

裘生沉吟片刻答道：

“准确的说新种对于其他一些臭味源也有一定的扼制作用但效果都远不如食物残渣和唾液细菌。”

徐云疑惑的看了他一眼问道：

“其他臭味源都有哪些？”

裘生立时掰持起了手指：

“厕所里的小八小汉堡还有小李找他室友要来的一小片两个礼拜没洗的手袜子还有”

“停停停打住打住！”

徐云额头顿时冒出了一股黑线连忙止住了裘生的描述。

随后他强迫自己平复了一番心情继续道：

“得你干脆直接报数据吧。”

裘生很是恶趣味的一笑又从桌上拿起了另一份报告：

“比起其他臭味源新种对于食物残渣和唾液细菌的效果简直可以用逆天来形容。”

“比如我们富集到的一个新种植株生物效能才8000单位小的可怜。”

“可它将一块03立方厘米大小的食物残渣彻底净化干净的时间前后也不过二十分钟罢了。”

说着说着裘生不由在徐云面前比划了个8的手势：

“这才8000单位啊你看现在青霉素的单位哪个不是百万级起步？”

“老徐你知道这意味着什么吗？”

徐云沉默片刻随后眉头一掀：

“代表着你的口臭有救了？”